他到任之后训练的三千巡防军名义上交军政府接管。又设法说服了刚刚接到东三省总督邀请，即将离川的前任大汉四川军政府副都督、原陆军第十七镇统制——朱庆澜，让他帮忙出面说服赵尔丰。第二日，赵尔丰经朱庆澜劝，同意将三千巡防军交由军政府接管。其后，尹昌衡借邀请巡防军将领过府商议军务，派杀手尽出六位管带，然后立刻将手下两千士兵跟三千巡防军大乱编制，掌握了成都城内全部兵权，一跃成为四川第二势力。
于此同时，再被何进趁机消灭了省内的势力之后，同盟会四川分会也不甘示弱。略微耽搁了一日，18日，以熊克武为蜀军总司令，彭家珍为副总司令的‘蜀军’在上海完成了招募，最终共募集两团六营，约莫近两千一百新兵，其中一千五百多人都是四川往江浙地区奔生活的年轻劳力，其余还有不少上海跟江浙地区的学生兵。18日晚，又经同盟会总理孙文亲自帮忙奔走联系之后，租借日本货轮鸟羽丸、东升丸、季赛、井野丸四艘三千吨大货轮，其余船只若干。19日正式离开上海往四川而去，预计28日可抵达四川！
除此之外这几日已经入川并抵达川南的滇军也不安生，在之前妄图争夺自贡盐业控制权失利之后，即联系云南之后，决口不再提及滇军入川之时所提议之保路军为匪类的‘入川三原则’，积极联络荣县、威远一代保路军，最终还是四川同盟会分会长吴玉章出面相助，说服了四川东路革命军副统领——王天杰，一同进攻自贡张本尧部。说起来这王天杰还有一个身份，那便是哥老会大佬。何进入川之后鉴于四川局势因保路之乱而导致各县匪类齐出
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