国成立之后，取消了贱民、良民之分，推行众民平等原则，同时也把所有的吏员全部都纳入到了政府官员的行列中，并且又加设了乡镇一级的行政机构，才算是加强了对地方行政的控制，由其是在商毅最早统治的八个省里，地方的各级行政制度都基本建立完成了。
但由于原来是处于战争时期，而且官员的人材缺乏，因此商毅并没有进一步建全地方行政机构、主要是在行政职能上，还是由知府、知州、知县一个人通盘全管，只是各级地方机构的人员多了一些。
那么现在就是该建全地方行政机构的时侯了，因此商毅决定，在乡、镇级行政单位设财政部；县级行政单位再加设文教部、农业部、商务部、组织部、宣传部，文书处共计七个部门；而省级，省会市、市级行政单位，再加设工程部、工业部、土地资源部、交通部，审计署共计十二个部门，另外根据各地的实际情况，省级，省会市、市级行政单位，还可以増加海洋开发部、民族事务部等其他部门。
在管理上，釆用双重管理方式，即各级地方的行政部门，即要对地方政府付责，同时也要受各自的上一级主管部门管理，各部门的付责官员由各级地方官员提名、再交各部门的上级部门审核批准。
而各地方的最高行政官员，在目前的阶段，省级和省会市、市级行政单位，是由皇帝或内阁推荐名单，然后交国会投票批准通过，就可以上任了，而任期时间为四年；县级行政单位，由其直属上级部门推荐，交由内阁批准，任期为三年；而乡、镇级行政单位则是由直属上级部门在当地选拔，交省级部门批准，任期为三年。
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