甲船的训练，到还十分满意，也对龟甲船寄于了厚望，因此也下令，将龟甲船单独编成一支舰队，都交给李杜国指挥。
在商毅出兵进攻马尼拉的时候，多尔衮曾把郑芝龙和李杜国都招到北京，一方面是询马尼拉的情况，另一方面也是了解海军的情况。
当时李杜国可是踌躇满志，信心十足，认为有了龟甲船之后，不必害怕中华军的海军，甚致向多尔衮请令，要带着龟甲舰队去进攻中华军在登州的海军基地。但郑芝龙的看法和李杜国刚刚相反，现在清廷的海军仅仅只是刚起步，根本不可能是中华军的对手，龟甲船根本就是华而不实，并不可大用，如果冒然进攻必败无疑。
其实郑芝龙故意把龟甲船贬得一钱不值，其实是用的激将法，希望多尔衮能让李杜国带着龟甲船出战一次，因为只有等李杜国被中华伏波军彻底打败了，清廷才能意识到自己的重要性，说不定会放松对自己的监视。