邵捷春竭尽所能，想要守住重庆府，可是在三月底的时候，李栓柱还是集结起了入川的兵力，开始对重庆府发动了猛攻。
镇东将军秦良玉领兵在重庆府城外和李栓柱所部进行了最后一次决战，可惜秦良玉麾下的白杆兵，基本上是由长枪兵构成，这些石柱兵将们，虽然在秦良玉的率领下很是勇猛善战，但是当面对这个时代武装十分先进的大中军的时候，却再也无法再现他们的勇猛无敌了，长射程武器的缺失，使得他们根本就没有公平的机会和大中军正面交手，所以会战的结果是秦良玉所部大败崩溃，秦良玉只得率领残部，突围逃回了老家石柱，无力再出战和李栓柱为敌了。
秦良玉白杆兵一败，整个重庆府的军心顿时大衰，李栓柱率部猛攻重庆府通远门，邵捷春恐慌之下，下令死守重庆府，守军无奈之下，只能在通远门一带死守，李栓柱猛攻通远门数日不克，气的李栓柱站在城外直骂娘，眼看守军在城门和城墙上矢石俱下，使得他麾下的兵将屡攻屡挫，而重庆府城城墙基本上都是以条石垒筑而成，异常高大坚固，炮轰也无法轰塌城墙，接着天又降下大雨，使得攻城不得不停止了下来。
所以三月间李栓柱在重庆府城外顿足不前，整整大半个月时间都未能破城，直至肖天健领兵北伐之后的三月底，李栓柱才利用火药炸塌了一小段通远门一带的城墙，率部攻入到了重庆府城中。
邵捷春这个巡抚一听说通远门被破，便立即带着家丁从城西水门乘船逃出了重庆府，逃往了成都府，但是城中瑞王和许多官吏却没有能逃走，大部分被李栓柱率兵俘获。
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