少数官僚地主、官僚商人手中，而自耕农、手工业者、小商人则因此纷纷破产。
所以从朱由检登基以来，他就知道。他最大的敌人不是后金的皇太极，也不是马上就要蜂拥起事的农民起义军，而是这些大地主、大商人在政治上的代表，东林党人。
对朱由检有利的一点是，中国传统政治对于朋党的深恶痛绝，导致东林党人并没成为一个联系紧密的组织，而是分成了以籍贯、学派、师生、亲友为联系的一个个小团体，虽然东林党人在维护大地主、大商人的阶级利益上是一致的，就是反对向大地主、大商人征税，反对朝廷开放海禁。
但是一个没有统一的政治纲领，且内部小团体互相倾轧的松散政治联盟，是没有多大的凝聚力的。所以天启初年，看似众正盈朝的东林党人，被魏忠贤纠集了一帮被东林党斗垮的残兵败将，就能让这些掌握了朝政的东林党人丢盔弃甲，退出了大明的中枢。